赣州电子工业技术学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力有所不同。赣州电子工业技术学校的毕业证书更注重职业技能培训，对于进入职场后的专业技能有一定的帮助。而普通高中毕业证书则更注重基础教育，为学生打下全面的知识基础。因此，两者的证书效力并不完全相同，具体效力还需根据具体需求和情况进行判断。